02 / HOLOBIONT THEORY

자연은 분해될 때가 아니라,
연결될 때 작동합니다

2005년 교토의정서에서 시작된 질문. 사람은 미생물과 함께 사는 통생명체(Holobiont)이며, 지구·인류·생태계는 하나의 운명 공동체입니다.

쉽게 말씀드리면

2005년, 저는 UNESCAP에 재직하던 가족을 통해 기후변화 대응에 관한 교토의정서를 접했습니다. 그때 저는 기후 위기가 단지 환경의 문제가 아니라, 식물과 미생물과 사람의 생명 연결이 끊어지는 문제라는 것을 보았습니다.

그 뒤 저는 유전자 비율 구조가 닮은 식물 세포와 인체 세포, 그리고 그 사이를 이어 주는 상리공생 미생물에 연구를 집중했습니다. Genome Project와 Post-genome 연구의 논문과 연구자들과의 교류, 기후변화 포럼에서 만난 석학들과의 대화가 이 연구를 단단하게 만들었습니다.

결론은 하나였습니다. 사람은 미생물과 함께 사는 통생명체(Holobiont)이고, 지구·인류·생태계는 하나의 운명 공동체라는 것. GRBM은 이 연결을 산업의 방식으로 구현하는 플랫폼입니다.

개발자 남우영
개발자 남우영2005년부터 식물·미생물·인체의 유전적 상호관계를 인트론의 관점에서 연구해 왔습니다.
2005년Holobiont 관점의 연구 시작
2010년세 가설을 통합한 첫 GRBM 모델
600명+태아부터 노인까지의 내부 관찰 (2010–2026)
12주대사 재정렬의 기준 기간

ONE HEALTH · HOLOBIONT

기후·식물·미생물이,
사람·대사체·사회로 이어집니다

Holobiont의 구조는 사람 몸 안에서 끝나지 않습니다. 기후의 변화는 식물의 영양·방어·대사 정보를 바꾸고, 식물은 토양과 몸속 미생물 생태계를 바꾸며, 미생물이 만든 대사체는 사람의 면역·대사·회복력을 바꿉니다. 그리고 사람의 건강은 다시 의료비와 생산성, 산업으로 이어집니다.

  • 기후온도·물·토양의 변화
  • 식물영양·방어·대사 정보
  • 미생물토양·식물·장내 생태계
  • 대사체생명 정보를 나르는 저분자
  • 인간면역·대사·회복력
  • 사회의료비·생산성·산업
ONE HEALTH 식물 미생물 사람 지구 식물에서 사람까지, 대사체로 이어진 하나의 대화
식물에서 사람까지, 대사체로 이어진 하나의 대화

ORIGIN HYPOTHESES · 2005–2010

2005–2010년에 세운
세 가지 원천 가설

식물 RNA × 유산균의 유전적 대화
01

식물 RNA × 유산균의 유전적 대화

식물세포가 내보내는 RNA를 식물 속 유산균이 받아들이고, 그 결과 만들어진 미생물 대사체가 다시 식물의 면역·성장·생식을 돕는다는 가설입니다.

대사적 휴식 × 세포 재정렬
02

대사적 휴식 × 세포 재정렬

이미 대사된 영양이 몸에 대사적 휴식을 주고, 세포는 그 기회에 인트론 발현을 통해 회복과 면역 재교육의 메커니즘을 작동시킨다는 가설입니다.

생식 건강: VGT × HGT × 대사 영양
03

생식 건강: VGT × HGT × 대사 영양

부모의 유전(VGT), 장내 미생물과의 교류(HGT), 태아가 바로 쓰는 대사 영양을 하나의 틀로 묶은 가설입니다.

2010년, 세 가설은
첫 번째 GRBM 모델로 통합되었습니다

그리고 그해, 세포 노화로 생사의 기로에 계시던 어머니께 드린 GRBM이 저의 첫 임상 성공이 되었습니다.

15 CONCEPTS

Holobiont 이론의
15개 개념 한눈에 보기

GRBM·VPMI는 20년 동안 쌓아 온 하나의 이론 위에 서 있습니다. 이 메뉴의 페이지들은 그 이론을 15개 개념으로 나누어 차례로 설명합니다.

  • 01 Holobiont한 사람은 사람과 미생물이 함께 사는 하나의 생태계입니다 → 세 요소
  • 02 유전체부모에게 받은 설계도 — 잘 발현되려면 좋은 재료가 필요합니다
  • 03 미생물군몸속 이웃 — GRBM은 소장 위쪽, 공장에 주목합니다
  • 04 대사체세 요소가 함께 쓰는 말 — 유전 정보도 실어 나릅니다
  • 05 두 가지 대사체일반 대사체는 효소가 필요하고, GRBM 대사체는 바로 쓰입니다
  • 06 홀로게놈셋이 어울릴 때 나타나는 '건강한 나'
  • 07 엑손·인트론레시피와 셰프의 메모 — 쓰임을 조절하는 인트론 → 유전과 노화
  • 08 텔로미어엑손의 길은 비가역적 노화, 인트론의 길은 가역적 노화 반응
  • 09 수직·수평 유전부모에게서 물려받고, 함께 사는 생명과 주고받습니다 → 세대를 잇는 유전
  • 10 마이크로키메리즘엄마와 아기가 나눈 세포는 27년 뒤에도 남습니다
  • 11 태아두 유전이 대사체로 처음 만나는 교차로
  • 12 엄마와 태아엄마는 ELAB의 도움으로 아기가 바로 쓰는 대사체를 만듭니다
  • 13 일반 의학과 GRBM같은 세 요소, 다른 자리
  • 14 GRBM세 요소에 한꺼번에 다가가 12주 동안 대사를 다시 정돈합니다
  • 15 One Health식물에서 사람까지, 대사체로 이어진 하나의 대화
더 보기접기생태적 시스템 생물학의 방법론과 세 원천 가설의 세부 내용

생태적 시스템 생물학에 따른 접근 방법

2005~2009년에 세운 저의 '식물 세포–미생물–인체 세포의 유전적 상관관계' 연구 가설은 시스템 생물학과 생태학의 관점을 함께 반영한 이론 체계였습니다. 저는 인체를 통합적인 신호 네트워크로 보았습니다. 질병은 이 신호 체계의 이상에서 생길 수 있고, 그 신호 체계에는 신경망을 통한 고전적 신호뿐 아니라 원격 신호와 유전물질을 통한 신호가 포함됩니다. 유전물질에 의한 신호 체계에서 제가 핵심 요소로 본 것이 miRNA였습니다.

화학 약물은 제조 과정에서 이성질체가 생겨 본래의 생체 기능을 해칠 위험을 안고 있습니다. 그래서 분자생물학만의 접근은 늘 다른 부작용의 위험을 동반합니다. 제 방법은 이성질체가 생기는 제조 단계를 없애고, 몸을 하나의 통합된 유기체(HOLOBIONT)로 보며, 각 세포에 부족하거나 잘못된 정보를 보충하고, 알맞은 바이오 물질을 공급해 생태적 자기 개선을 이끄는 것입니다. 저는 이것을 '생태 바이오 과학의 영역'이라 부릅니다.

원천 가설 01 — 식물 RNA와 유산균의 유전적 대화

식물세포는 mRNA, small RNA 같은 조절 RNA를 세포 밖 공간이나 세포외 소포체(extracellular vesicle) 형태로 내보냅니다. 식물체 안의 Lactobacillus가 이 RNA나 그 정보에 노출·획득되면, 역전사·재조합·RNA 유도 DNA 변형·DNA 수선과 선택 같은 경로를 거쳐 서로 떨어진 여러 위치(대표 모델에서 약 3곳)에서 한 염기 수준의 변화가 선택·고정될 수 있다고 저는 보았습니다.

서로 떨어진 단일염기 변화의 조합은 유전자 발현, 효소 기능, 운반체, 대사 경로를 바꿀 수 있습니다. 그렇게 형성된 미생물 대사체(microbial metabolome)가 식물의 면역·성장·스트레스 저항·생식을 돕고, 식물 환경은 다시 그 미생물의 적합도를 높이는 순환 고리를 이룹니다. 이 시각이 GRBM의 '식물–식물체 유산균–인체' 설계로 이어졌습니다.

원천 가설 02 — 대사적 휴식이 여는 세포 재정렬

GRBM은 인체에 대사적 휴식을 제공한다. 대사적 휴식을 통해 세포는 대사재정렬이 이루어지고, 장기간 대사재정렬의 기회를 세포에게 제공하면 유전자의 INTRON 발현을 통해 인체 건강 회복 메커니즘과 면역세포 재교육 메커니즘이 동작한다.

개발자 원문
  1. 01
    GRBM 대사적 휴식

    대사된 영양을 공급해 소화·변환의 부담을 줄입니다

  2. 02
    세포 대사재정렬

    장기간 반복되는 재정렬의 기회

  3. 03
    INTRON 발현

    유전자의 비단백질 영역이 깨어납니다

  4. 04
    회복 · 면역 재교육

    건강 회복 메커니즘과 면역세포 재교육이 작동합니다

저는 이 가설의 핵심 요소로 External miRNA를 지정했습니다. 외인성 miRNA를 정제·추출해 활용하면 암·노화·RNA 바이러스 대응에 새로운 길이 열리고, 이를 미래 농업 바이오 산업으로 키울 수 있다고 보았습니다. 그리고 기술과 기업 역량을 가늠하는 기준으로 '현대 의학으로 해결하기 어려운 난치성 질환자가 12주 안에 새로운 건강한 삶을 얻을 수 있는가'를 세웠습니다.

원천 가설 03 — 생명의 시작을 위한 세 가지 설계 개념

생식 건강 가설의 세 개념
개념 뜻 개발자의 관점
VGT (수직 유전) 부모에게서 자식으로 이어지는 유전 호르몬 지표가 중요한 일반적 임신 경로
HGT (수평 유전) 함께 사는 생명과 주고받는 유전 정보 인간 유전자의 인트론 부위와 소장 공장(jejunum) 미생물 사이의 교류가 임신 가능성에 관여
대사 영양 세포가 바로 쓰는 영양 복부대동맥을 통해 하복부에 저장되어, 소화기관이 발달하지 않은 태아에게 곧바로 제공될 수 있는 Metabolome 형태의 영양

특히 고령 산모는 호르몬과 효소로 영양을 만들고 저장·변환하기 어렵기 때문에, 이미 대사된 형태의 영양이 필요하다는 것이 제 가설입니다. "장내 미생물 생태계를 Vital Probiotics로 유익 미생물 중심으로 재편하면 임신 가능성이 생길 수 있다"는 가설을 세워 난임 사례에 적용했고, 5건의 시도에서 5건 모두 임신에 이르는 결과를 관찰했습니다. 그 기록은 600명·15년의 관찰 기록에 정리되어 있습니다.

출처: 개발자(남우영)의 연구 및 완결본 제안서 첨부 5 「나는 GRBM을 확신한다」. 원천 가설은 질병별 임상 논문과 독립 검증으로 하나씩 공개해 나갑니다.

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